Al usar un Panel Extender el posicionamiento es correcto en Firefox pero en las versiones de Internet Explorer solamente se puede asegurar un lugar fijo incluyendo los items dentro de un panel al que se le asigna un estilo. Por ejemplo al panel:

<code><asp:Panel ID="pnlMyPanel" Height="100px" width="80px" CssClass="pnlPanelExtender" runat="Server"></code>

Y en la hoja de estilos o una etiqueta style:

.pnlPanelExtender{position:relative;}